Od roku 1992 sa hrala v Bardejove I. SNL. Túto súťaž hráči BSC v sezóne 1993/94 vyhrali a od budúceho ročníka štartovali v najvyššej slovenskej súťaži. Trénerom bol Jozef Bubenko a o postup sa zaslúžili: Ľ. Lukáč, Kováč - Jurčák, Ondrišin, Futej, J. Lukáč, Pariľák, Ľalík, J. Daňko, Tyč, Vilím, Š. Jacko, Kováč, Kramár, Novotný, Horochonič, S. Varga, Štúň, Danielis ,Tkáč, Berežný. Priemerná návšteva v tomto ročníku na štadióne BŠK bola 2000 divákov, čo je šestina všetkých divákov v súťaži. Najlepšími strelcami BŠK boli Tyč a Ľalík s 9 gólmi.
V prvom ročníku účinkovania v najvyššej súťaži skončil BSC na 7. mieste. Priemerná návštevnosť bola 5 826 divákov (vyššia len v Trnave 6 795). V nasledujúcich ročníkoch skončil BSC na 6. , 7., 14. a 16. mieste. Farby klubu boli v tom čase žltá, fialová a biela. Štadión mal kapacitu 12 000 miest, z toho 3000 na sedenie.
BSC Jas Bardejov v najvyššej súťaži :
Ročník 1994-95 – Bardejovčania si, ako nováčik, počínali dobre a medzi dvanástimi účastníkmi najvyššej súťaže obsadili siedme miesto s bilanciou 32 12 7 13 46:46. Získali 43 bodov. Káder tvorili (číslo pri mene je počet odohratých zápasov): Stanislav Hvozda 17, Miroslav Kováč 14, Ľuboš Lukáč, Marián Ľalík 32, Marián Šuchančok 31, Jozef Daňko 31, Peter Futej 28, Ján Jurčák 28, Ján Chrenko 28, Alexander Tyč 27, Jozef Hrivňák 25, Jozef Lukáč 22, Štefan Jacko 21, František Vilím 19, Ján Onderišin 17, Jozef Urblík 16, Slavomír Prúčny 12, Richard Varadín 11, Jozef Pariľák 11, Peter Kaľavský 9, Ľubomír Horochonič 5, Radoslav Stoják 3, Ján Kramár 2, Róbert Harčár 2. Tréner Jozef Bubenko, asistenti Gabriel Bocko, Július Pašiak. Strelci gólov: Urblík 9, Chrenko 6, Tyč, J. Lukáč, Daňko po 5, Varadín, Jacko, Ľalík po 3, Hrivňák, Prúčny po 2, Káľavský, Futej, Vilím po 1.
Ročník 1995-96: Tentoraz Hornošarišania dostali do elitnej šestky (súťaž sa po odohratí základnej časti delila na dve skupiny), a tak nemali problémy so záchranou. Aj to bol asi jeden z dôvodov prečo v nadstavbe výkony poklesli, získali len bod a dali štyri góly. Aj tak skončili na výbornom šiestom mieste s bilanciou 32 13 3 16 38:42 a získali 42 bodov. Káder tvorili: Ľuboš Lukáč 21, Stanislav Hvozda 12, Peter Futej 31, Slavomír Prúčny 30, Jozef Urblík 30, Marián Šuchančok 28, Ján Jurčák 27, Ján Chrenko 26, Ján Hrivňák 26, Jozef Daňko 25, Jozef Lukáč 17, František Vilím 25, Štefan Jacko 25, Alexander Tyč 21, Jozef Pavlík 16, Marián Ľalík 13, Igor Kasana 12, Peter Kavka 12, Radoslav Stoják 11, Ľubomír Micák 11, Róbert Harčár 5, Vladimír Leitner 3, Patrik Zajac 2. Tréner Jozef Bubenko, asistenti Gabriel Bocko, Július Pašiak, Strelci gólov: Hrivňák 8, Urblík 7, Prúčny 5, J. Daňko 4, Šuchančok, Pavlík po 3, Lukáč, Tyč, Stoják po 2, Kasana, Jacko po 1.
Ročník 1996-97: Ligou už ostrieľaní Bardejovčania skončili na 7. mieste. Z mužstva, pred začatím súťaže, odišiel celý rad skúsených hráčov, a tak tréner Kisel musel kolektív prestavať. Jedným z problémov bola kolísavosť vo výkonoch. Aj tak je konečné umiestnenie považovať za úspech. Bilancia: 30 11 7 12 34:36 40. Káder tvorili: Ľuboš Lukáč 20, Juraj Čobej 9, Stanislav Hvozda 1, Peter Futej 29, Ján Chrenko 29, Štefan Jacko 28, Slavomír Prúčny 27, Jozef Lukáč 25, Jozef Urblík 14, Jozef Pavlík 13, Zoltán Szorád 12, Ondrej Desiatnik 10, Ján Jurčák 9, Norbert Toman 6, František Vilím 25, Ľubomír Jacko 24, Jozef Hrivňák 22, Martin Lukáč 19, Marián Borgoň 16, Marián Ľalík 16, Jozef Daňko 15, Anton Spišák 14, Attila Erdélyi 5, Ľubomír Micák 4, Dezider Varga 3, Igor Jančevski 3, Ľuboš Baláž 1. Tréner Karol Kisel, asistent Jaroslav Rybár. Strelci gólov: Ľ. Jacko 7, Hrivňák, Ľalík po 5, Urblík, Chrenko po 3, Š. Jacko, Szorád po 2, Vilím, Pavlík, M. Lukáč, D. Varga, Borgoň Prúčny, J. Lukáč po 1.
Ročník 1997-98: Bardejovčania skončili na 14. mieste. Po jeseni boli poslední a zachránili sa až v závere súťaže - bilancia 30 7 6 17 27:42 17. Káder prešiel značnou prestavbou a noví hráči nepotvrdili očakávanie. Úmerne slabým výkonom sa menili aj tréneri. V tomto ročníku sedeli na lavičke BSC postupne až traja.
Káder: Juraj Čobej 30, Ján Heredoš 1, Jiří Bartoš 1, Ľubomír Jacko 26, Zoltán Szorád 26, Ľuboš Krochta 25, Peter Futej 24, Martin Lukáč 22, Marián Ľalík 19, Anton Spišák 18, Marián Kočiš 17, Jozef Pisár 16, Štefan Jacko 15, Slavomír Prúčny 14, Ján Chrenko 14, Marián Timko 14, František Myslík 14, Richard Höger 13, Vladimír Malár 12, Jozef Hrivňák 11, Róbert Vojvoda 11, Radovan Stoják 10, Saša Glavaš 9, Alexander Tyč 8, Anton Spišák 7, Marián Borgoň 6, Juraj Adlen 4, Ján Jurčák 3, Marek Figlár 2, Ondrej Desiatnik 1, Róbert Harčár 1, Peter Vaško 1. Tréneri Karol Kisel, Jaroslav Belejčák, Dušan Radolský, asistenti Jozef Žofaj, Peter Rybár. Strelci gólov: Ľ. Jacko, Ľalík po 5, Pisár 4, Szorád 3, Krochta, Malár, Höger po 2, Prúčny, Š. Jacko, Kočiš, Čobej po 1.
Ročník 1998-99: Bardejovčania skončili na poslednom (šestnástom) mieste a so súťažou sa rozlúčili. Dosiahli bilanciu 30 2 1 27 14:66 7. V ročníku 1998-99 z klubu odišiel najväčší sponzor a BSC (neskôr BŠK) sa postupne prepadol až do 3. ligy, kde pôsobil niekoľko rokov. Klub sa vrátil k pôvodnému názvu Partizán Bardejov. V roku 2012 postúpil do 2. ligy, v ktorej účinkuje doteraz.