1. Marek Mintál (MŠK Žilina), Róbert Vittek (Slovan Bratislava) - 15 gólov
3. Martin Fabuš (Laugaricio Trenčín 8/MŠK Žilina 6) - 14 gólov
4. Juraj Halenár (Inter Bratislava) - 9 gólov
5. Ľuboš Perniš (Matador Púchov), Miroslav Drobňák, Július Lelkeš (obaja Inter Bratislava), Ľubomír Mati (1. FC Košice), Pavol Straka (ZTS Dubnica) - 8 gólov
10. Vladimír Kožuch, Souleymane Fall (obaja Spartak Trnava), Peter Vavrík (Matador Púchov), Milan Ivana (Laugaricio Trenčín) - 7 gólov
14. Vladimír Helbich, Roland Števko (obaja MŠK SCP Ružomberok), Michal Gottwald (MŠK Žilina), Peter Kiška (ZTS Dubnica), Ladislav Suchánek (Artmedia Petržalka) - 6 gólov
19. Branislav Obžera, Peter Dzúrik (obaja Slovan Bratislava), Mário Breška (Matador Púchov), Martin Obšitník (1. FC Košice 4/Artmedia Petržalka 1) - 5 gólov
23. Dušan Sninský, Radoslav Zábavník (obaja MŠK Žilina), Ján Kozák ml., Roman Lazúr (obaja 1. FC Košice), Benjamín Vomáčka, Ladislav Onofrej (obaja Slovan Bratislava), Róbert Rák (MŠK SCP Ružomberok), Miroslav Kriss, Michal Gašparík ml., Pavol Staňo (všetci Spartak Trnava), Karel Vácha, Anton Šoltis, Vladimír Kinder (všetci Artmedia Petržalka), Václav Spal (Laugaricio Trenčín), Alias Lembakoali (Inter Bratislava) - 4 góly
38. Pavol Kopačka, Marián Staš, Michal Otočka (všetci Laugaricio Trenčín), Vladislav Zvara, Štefan Maixner, Tomáš Medveď (všetci Artmedia Petržalka), Richard Varadin, Štefan Rusnák, Branislav Labant, Marek Bažík, Martin Ďurica (všetci MŠK Žilina), Marián Tomčák, Radovan Kocúrek (obaja Inter Bratislava), Ján Šlahor, Stanislav Šesták (obaja Slovan Bratislava), Andrej Filip (Spartak Trnava), Jozef Jelšic, Rudolf Urban (obaja MŠK SCP Ružomberok), Marek Sapara (1. FC Košice), Ivan Kováč (Matador Púchov) - 3 góly
58. Martin Laurinc (MŠK Žilina 1/MŠK SCP Ružomberok 1), Róbert Hazucha, Štefan Zošák, Marián Kurty (všetci MŠK SCP Ružomberok), Marek Ujlaky (Spartak Trnava), Peter Doležaj, Petr Lysáček, Ján Sokol, Marián Bellák, Andrej Porázik, Juraj Dovičovič (všetci ZTS Dubnica), Miroslav Sovič, Pavel Kulig (obaja 1. FC Košice), Miloš Soboňa, František Ševínský (obaja Artmedia Petržalka), Pavol Vavrík, Juraj Škripec, Jozef Bugala, Ivan Belák, Jozef Mužlay (všetci Matador Púchov), Róbert Hanko, Dušan Miklas, Peter Ďuriš (všetci Laugaricio Trenčín), David Homoláč (Slovan Bratislava) - 2 góly
82. Anton Suchý, Martin Ševela, Martin Švestka, Alexander Golokolosov, Ján Švikruha, Igor Držík (všetci ZTS Dubnica), Tomáš Zárecký, Henrich Benčík, Martin Bednár, Milan Kusalík, Martin Mikulič, Ondrej Debnár (všetci Artmedia Petržalka), Marcel Loj, Marián Juhás, Vladimír Semanco, Rastislav Ďorď, Eduard Mydliar (všetci 1. FC Košice), Vladimír Staš, Miroslav Barčík, Cyril Špendla (všetci MŠK Žilina), Róbert Ovad, Jozef Privarčák, Milan Jambor (všetci Matador Púchov), Marián Molnár, Gabriel Sikorjak, Roman Konečný, Erik Ježík, Peter Hluško, Martin Poljovka, Peter Hodúr, Dušan Bestvina (všetci Spartak Trnava), Roman Hrnčár, Miroslav Bédi, Rastislav Tomovčík, Igor Žofčák, Jiří Pospíšil (všetci MŠK SCP Ružomberok), Radoslav Kunzo, Augustín Paulík, Igor Chalupka (všetci Inter Bratislava), Eduard Hrnčár, Pavol Sedlák, Norbert Hrnčár, Vladimír Bednár, Ladislav Pecko, Peter Polgár, Tomáš Sloboda (všetci Slovan Bratislava), Ondrej Šmelko, Milan Mičenec, Marcel Svrček, Radim Krupník, Miloš Jakúbek (všetci Laugaricio Trenčín) - 1 gól
(dovedna 132 strelcov)
Vlastné góly: Marek Petruš (Slovan Bratislava), Marián Juhás, Juraj Beňo (obaja 1. FC Košice), Radoslav Zábavník (MŠK Žilina), Jozef Gáspár (Inter Bratislava), Erik Ježík (Spartak Trnava), Jiří Pospíšil (MŠK SCP Ružomberok), Marián Zimen (ZTS Dubnica)
