1. Roland Števko (MFK Ružomberok) - 14 gólov
2. Marek Krejčí (Artmedia Petržalka) - 12 gólov
3. Marek Bažík (MŠK Žilina), Vladimír Kožuch (Spartak Trnava), Juraj Dovičovič (ZTS Dubnica) - 10 gólov
6. Róbert Semeník (Dukla Banská Bystrica) - 9 gólov
7. Marek Ujlaky (Spartak Trnava) - 8 gólov
8. Jozef Jelšic (MFK Ružomberok), Ivan Bartoš (Dukla Banská Bystrica), Dušan Sninský (MŠK Žilina) - 7 gólov
11. Miroslav Nemec (Matador Púchov), Miroslav Kriss (Spartak Trnava), Adam Nemec (ZTS Dubnica), Ladislav Onofrej (Slovan Bratislava) - 6 gólov
15. Juraj Halenár (Inter Bratislava), Stanislav Velický (AS Trenčín), Peter Kiška (ZTS Dubnica), Radoslav Zabavník (MŠK Žilina) - 5 gólov
19. Marián Kurty, Rudolf Urban, Jiří Pospíšil (všetci MFK Ružomberok), Filip Šebo, Alias Lembakoali (obaja Inter Bratislava), Miroslav Sovič (Dukla Banská Bystrica), Branislav Fodrek (Slovan Bratislava), Martin Fabuš (MŠK Žilina), Mário Breška (Matador Púchov), Anton Šoltis (Artmedia Petržalka) - 4 góly
29. Michal Kubala, Róbert Hanko (obaja AS Trenčín), Michal Gašparík (Spartak Trnava), Peter Čvirik, Ivan Belák (obaja Matador Púchov), Balázs Borbély, Ladislav Suchánek (obaja Artmedia Petržalka), Blažej Vaščák (Artmedia Petržalka 2/AS Trenčín 1), Ľubomír Vyskoč (Dukla Banská Bystrica) - 3 góly
38. Peter Majerník (Matador Púchov), Róbert Vittek, Stanislav Šesták, Patrik Volf, Milorad Bukvič, Erik Takáč (všetci Slovan Bratislava), Igor Chalupka, Augustín Paulík, Radoslav Kunzo (všetci Inter Bratislava), Ján Kozák ml. (Artmedia Petržalka), Michal Gottwald, Vladimír Staš, Martin Ďurica, Miroslav Barčík (všetci MŠK Žilina), František Kunzo, Martin Jakubko, Viktor Pečovský, Radovan Kulík (všetci Dukla Banská Bystrica), Miroslav Kozák, Milan Ivana, Marián Vavruš, Milan Mičenec, Ivan Lietava (všetci AS Trenčín), Peter Tomko (MFK Ružomberok), Souleymane Fall (Spartak Trnava) - 2 góly
63. Juraj Chlebo, Jozef Gáspár, Marián Tomčák ml., Marek Čech ml. (všetci Inter Bratislava), Pavol Kopačka, Pavol Šuhaj (obaja AS Trenčín), Pavol Masaryk, Andrej Filip, Peter Ďuriš, Erik Ježík, Jaroslav Hrabal (všetci Spartak Trnava), Peter Jurčo, Martin Laurinc, Vladimír Helbich, Marián Had, Miroslav Latiak, Marek Sapara (všetci MFK Ružomberok), Martin Mikulič, František Ševinský, František Hanc (všetci Artmedia Petržalka), Zdeno Štrba, Michal Drahno, Štefan Rusnák, Tomáš Šimček, Cyril Špendla (všetci MŠK Žilina), Peter Doležaj, Martin Švestka, Andrej Šupka, Anton Suchý, Marián Zimen, Martin Doktor, Matej Ižvolt (všetci ZTS Dubnica), Ľuboš Perniš, Almir Gegič, Milan Jambor, Peter Vavrík, Ján Beliančin (všetci Matador Púchov), Martin Svintek, Vladimír Veselý, Jaroslav Kentoš, Tomáš Libič (všetci Dukla Banská Bystrica), Eduard Hrnčár, Norbert Hrnčár, Benjamin Vomáčka, Branislav Obžera, Tomáš Sloboda, Ján Šlahor, Zsolt Hornyák (všetci Slovan Bratislava) - 1 gól
(dovedna 110 strelcov)
Vlastné góly: Pavol Vavrík (Púchov) - 1
