Štyridsať mužstiev rozdelil žreb do ôsmich päťčlenných skupín, v ktorých sa tímy stretnú jednokolovo každý s každým, t. j. jedno mužstvo odohrá dve stretnutia v domácom prostredí a dve na súperovej pôde.
Do 3. kola Pohára UEFA postúpia prvé tri tímy z každej skupiny (spolu 24), ktoré na celkový počet 32 mužstiev doplní osem klubov z tretích miest zo základných skupín Ligy majstrov. Potom sa už bude hrať klasickým vyraďovacím systémom (doma - vonku). Finálový duel aktuálneho ročníka druhej najprestížnejšej európskej pohárovej klubovej súťaže je na programe v stredu 10. mája 2006 na štadióne Phillips Arena v holandskom Eindhovene.
Program zápasov skupinovej fázy Pohára UEFA:
A-skupina: AS Monaco (Fr.), Slavia Praha (ČR), Hamburger SV (Nem.), CSKA Sofia (Bulh.), Viking Stavanger (Nór.)
PROGRAM ZÁPASOV
1. kolo - 20. októbra: CSKA Sofia - Hamburger SV, Viking Stavanger - AS Monaco
2. kolo - 3. novembra: Hamburger SV - Viking Stavanger, Slavia Praha - CSKA Sofia
3. kolo - 24. novembra: AS Monaco - Hamburger SV, Viking Stavanger - Slavia Praha
4. kolo - 30. novembra: Slavia Praha - AS Monaco, CSKA Sofia - Viking Stavanger
5. kolo - 15. decembra: AS Monaco - CSKA Sofia, Hamburger SV - Slavia Praha
B-skupina: Lokomotiv Moskva (Rus.), Espanyol Barcelona (Šp.), US Palermo (Tal.), Bröndby IF Kodaň (Dán.), Maccabi Petach-Tikva (Izr.)
PROGRAM ZÁPASOV
1. kolo - 20. októbra: Maccabi Petach-Tikva - US Palermo, Lokomotiv Moskva - Espanyol Barcelona (*tento duel sa hrá už 19. 10.)
2. kolo - 3. novembra: US Palermo - Lokomotiv Moskva, Bröndby IF Kodaň - Maccabi Petach-Tikva
3. kolo - 24. novembra: Espanyol Barcelona - US Palermo, Lokomotiv Moskva - Bröndby IF Kodaň (*tento duel sa hrá už 23. 11.)
4. kolo - 30. novembra: Bröndby IF Kodaň - Espanyol Barcelona, Maccabi Petach-Tikva - Lokomotiv Moskva
5. kolo - 15. decembra: Espanyol Barcelona - Maccabi Petach-Tikva, US Palermo - Bröndby IF Kodaň
C-skupina: Hertha BSC Berlín (Nem.), Racing Lens (Fr.), Sampdoria Janov (Tal.), Steaua Bukurešť (Rum.), Halmstad BK (Švéd.)
PROGRAM ZÁPASOV
1. kolo - 20. októbra: Steaua Bukurešť - Racing Lens, Halmstad BK - Hertha BSC Berlín
2. kolo - 3. novembra: Racing Lens - Halmstad BK, Sampdoria Janov - Steaua Bukurešť
3. kolo - 24. novembra: Hertha BSC Berlín - Racing Lens, Halmstad BK - Sampdoria Janov
4. kolo - 30. novembra: Sampdoria Janov - Hertha BSC Berlín, Steaua Bukurešť - Halmstad BK
5. kolo - 15. decembra: Hertha BSC Berlín - Steaua Bukurešť, Racing Lens - Sampdoria Janov
D-skupina: AZ Alkmaar (Hol.), FC Middlesbrough (Angl.), Dnepr Dnepropetrovsk (Ukr.), Grasshoppers Zürich (Švajč.), Litex Loveč (Bulh.)
PROGRAM ZÁPASOV
1. kolo - 20. októbra: Grasshoppers Zürich - FC Middlesbrough, Dnepr Dnepropetrovsk - AZ Alkmaar
2. kolo - 3. novembra: FC Middlesbrough - Dnepr Dnepropetrovsk, Litex Loveč - Grasshoppers Zürich
3. kolo - 24. novembra: AZ Alkmaar - FC Middlesbrough, Dnepr Dnepropetrovsk - Litex Loveč
4. kolo - 30. novembra: Litex Loveč - AZ Alkmaar, Grasshoppers Zürich - Dnepr Dnepropetrovsk
5. kolo - 15. decembra: AZ Alkmaar - Grasshoppers Zürich, FC Middlesbrough - Litex Loveč
E-skupina: AS Rím (Tal.), FC Bazilej (Švajč.), CZ Belehrad (Srb. a Č. Hora), Racing Štrasburg (Fr.), Tromsö IL (Nór.)
PROGRAM ZÁPASOV
1. kolo - 20. októbra: FC Bazilej - Racing Štrasburg, Tromsö IL - AS Rím
2. kolo - 3. novembra: Racing Štrasburg - Tromsö IL, CZ Belehrad - FC Bazilej
3. kolo - 24. novembra: AS Rím - Racing Štrasburg, Tromsö IL - CZ Belehrad
4. kolo - 1. decembra: CZ Belehrad - AS Rím, FC Bazilej - Tromsö IL
5. kolo - 14. decembra: AS Rím - FC Bazilej, Racing Štrasburg - CZ Belehrad
F-skupina: CSKA Moskva (Rus.), Olympique Marseille (Fr.), SC Heerenveen (Hol.), Levski Sofia (Bulh.), Dinamo Bukurešť (Rum.)
PROGRAM ZÁPASOV
1. kolo - 20. októbra: Dinamo Bukurešť - SC Heerenveen, CSKA Moskva - Olympique Marseille
2. kolo - 3. novembra: SC Heerenveen - CSKA Moskva, Levski Sofia - Dinamo Bukurešť
3. kolo - 24. novembra: Olympique Marseille - SC Heerenveen, CSKA Moskva - Levski Sofia
4. kolo - 1. decembra: Levski Sofia - Olympique Marseille, Dinamo Bukurešť - CSKA Moskva
5. kolo - 14. decembra: Olympique Marseille - Dinamo Bukurešť, SC Heerenveen - Levski Sofia
G-skupina: VfB Stuttgart (Nem.), PAOK Solún (Gréc.), Šachťor Doneck (Ukr.), Stade Rennes (Fr.), Rapid Bukurešť (Rum.)
PROGRAM ZÁPASOV
1. kolo - 20. októbra: Stade Rennes - VfB Stuttgart, Šachťor Doneck - PAOK Solún
2. kolo - 3. novembra: VfB Stuttgart - Šachťor Doneck, Rapid Bukurešť - Stade Rennes
3. kolo - 24. novembra: PAOK Solún - VfB Stuttgart, Šachťor Doneck - Rapid Bukurešť
4. kolo - 1. decembra: Rapid Bukurešť - PAOK Solún, Stade Rennes - Šachťor Doneck
5. kolo - 14. decembra: PAOK Solún - Stade Rennes, VfB Stuttgart - Rapid Bukurešť
H-skupina: Besiktas Istanbul (Tur.), FC Sevilla (Šp.), Bolton Wanderers (Angl.), Zenit Petrohrad (Rus.), Vitória Guimaraes (Portug.)
PROGRAM ZÁPASOV
1. kolo - 20. októbra: Besiktas Istanbul - Bolton Wanderers, Zenit Petrohrad - Vitória Guimaraes
2. kolo - 3. novembra: Bolton Wanderers - Zenit Petrohrad, FC Sevilla - Besiktas Istanbul
3. kolo - 24. novembra: Vitória Guimaraes - Bolton Wanderers, Zenit Petrohrad - FC Sevilla
4. kolo - 1. decembra: FC Sevilla - Vitória Guimaraes, Besiktas Istanbul - Zenit Petrohrad
5. kolo - 14. decembra: Vitória Guimaraes - Besiktas Istanbul, Bolton Wanderers - FC Sevilla
*Pozn.: Lokomotiv Moskva odohrá v B-skupine svoje dva domáce zápasy v 1. a 3. kole (19. 10., resp. 23. 11.) už o deň skôr (t. j. v stredu), pretože vo štvrtok (20.10. a 24. 11.) nastúpi v domácom prostredí v F-skupine ďalší moskovský klub CSKA.
