Po Varta Futsal Lige 2020/2021 sa vo výrazne redukovanej podobe odohrá aj Futsalová extraliga 2020/2021 v oboch juniorských vekových kategóriách (do 20, resp. 17 rokov). Keďže od 18. júna 2021 sú plánované reprezentačné sústredenia spojené s medzištátnymi zápasmi pre výber do 19 rokov (dve prípravné stretnutia v Portugalsku, 29. a 30.6.), ako aj pre výber do 17 rokov (dve prípravné stretnutia s Francúzskom v Piešťanoch, 22. a 23.6.), bolo potrebné nájsť vhodný herný systém vtesnaný do tohto dvaapoltýždňového obdobia. 

FEJ U-20 sa odohrá za účasti 10 prihlásených klubov v troch fázach:

1.fáza: odohrá sa v dvoch kvalifikačných skupinách; 10 prihlásených klubov bude žrebom rozdelených do dvoch kvalifikačných skupín, z ktorých prví traja postúpia do 2.fázy; v skupinách sú nasadené kluby, ktoré sú organizátormi týchto skupín (4FSC Bratislava, Futsal Team Levice) 

2.fáza (termín 7. alebo 8. jún 2021): 6 postupujúcich klubov z 1.fázy bude žrebom rozdelených do dvoch skupín, z ktorých prví dvaja postúpia do Final Four; v skupinách budú nasadené kluby, ktoré budú organizátormi týchto skupín, ďalšou podmienkou pre žrebovanie bude, aby sa víťazi kvalifikačných skupín z 1.fázy nestretli v rovnakej skupine 2.fázy 

3.fáza (termín 12.-13. jún 2021, PÚCHOV): Final Four za účasti 4 najlepších klubov z 2.fázy (semifinále: A1-B2, B1-A2). Víťaz Final Four získa titul Majster Slovenska pre sezónu 2020/2021.

FEJ U-17 sa odohrá za účasti 7 prihlásených klubov v dvoch na seba nadväzujúcich fázach: 

1.fáza: odohrá sa v dvoch kvalifikačných skupinách; 7 prihlásených klubov bude žrebom rozdelených do dvoch kvalifikačných skupín, z ktorých prví dvaja postúpia do 2.fázy; v skupinách sú nasadené kluby, ktoré sú organizátormi týchto skupín (Ridop Miba Banská Bystrica, Podpor pohyb Košice) 

2.fáza (termín 15.-16. jún 2021, PÚCHOV):: Final Four za účasti 4 najlepších klubov z 1.fázy (semifinále: A1-B2, B1-A2). Víťaz Final Four získa titul Majster Slovenska pre sezónu 2020/2021.

V dňoch 31.5 a 1.6. sa odohrajú dve skupiny 1.fázy FEJ U-20. Desať tímov, ktoré sa na jeseň prihlásili do Futsalovej extraligy juniorov do 20 rokov, je rozdelených do dvoch skupín po piatich. Prvá sa hrá v Bratislave, kde sa počas posledného májového dňa predstavia 4FSC Bratislava, Pinerola Bratislava, MŠK Žilina FUTSAL, TNF Prievidza a Ekoprim Prešov. Na úvodný júnový deň sa zase v Leviciach zídu domáci tím Futsal Team Levice, MŠK Mayerson Nové Zámky, ŠK Makroteam Žilina, Mimel Lučenec a Podpor pohyb Košice. Stretnutia sa hrajú 2x15 minút hrubého času, pričom posledné dve minúty stretnutia sa hrajú v čistom čase.

Skupina A (Bratislava, pondelok 31. mája 2021)

9,15 h. 4FSC Bratislava - Pinerola Bratislava

10,20 h. MŠK Žilina Futsal - TNF Prievidza

11,25 h. Ekoprim Prešov - 4FSC Bratislava

12,15 h. Pinerola Bratislava - TNF Prievidza

13,05 h. MŠK Žilina Futsal - Ekoprim Prešov

13,55 h. 4FSC Bratislava - TNF Prievidza

14,45 h. Pinerola Bratislava - MŠK Žilina Futsal

15,35 h. Ekoprim Prešov - TNF Prievidza

16,25 h. 4FSC Bratislava - MŠK Žilina Futsal

17,15 h. Pinerola Bratislava - Ekoprim Prešov

Skupina B (Levice, utorok 1.júna 2021)

9,15 h. Futsal Team Levice – MŠK Mayerson Nové Zámky

10,20 h. ŠK Makroteam Žilina – Mimel Lučenec

11,25 h. Podpor pohyb Košice - Futsal Team Levice

12,15 h. MŠK Mayerson Nové Zámky – Mimel Lučenec

13,05 h. ŠK Makroteam Žilina - Podpor pohyb Košice

13,55 h. Futsal Team Levice – Mimel Lučenec

14,45 h. MŠK Mayerson Nové Zámky – ŠK Makroteam Žilina

15,35 h. Podpor pohyb Košice - Mimel Lučenec

16,25 h. Futsal Team Levice – ŠK Makroteam Žilina

17,15 h. MŠK Mayerson Nové Zámky – Podpor pohyb Košice