Na druhom mieste skončil obhajca majstrovského titulu Michael Schumacher na Ferrari pred víťazom 1. tréningu Pedrom de la Rosom na McLarene.
Výsledky 2. meraného tréningu VC Japonska: 1. Ricardo Zonta (Braz./Toyota) 1:30,682, 2. Michael Schumacher (Nem./Ferrari) 1:31,716, 3. Pedro de la Rosa (Špan./McLaren) 1:31,821, 4. Rubens Barrichello (Braz./Ferrari) 1:32,267, 5. Kimi Räikkönen (Fín./McLaren) 1:32,849, 6. Ralf Schumacher (Nem./Toyota) 1:32,917, 7. Jarno Trulli (Tal./Toyota) 1:33,122, 8. Fernando Alonso (Špan./Renault) 1:33,259, 9. Jenson Button (V.Brit./BAR) 1:33,453, 10. Mark Webber (Aus./Williams) 1:33,520
