Agüero vstúpil do profesionálneho futbalu už vo veku 15 rokov, keď nastúpil v argentínskej najvyššej súťaži za Independiente Buenos Aires.
Do Európy prišiel v roku 2006. Jeho prvým tímom bolo Atlético Madrid, do City prestúpil v roku 2011. Celkovo odohral v kariére 786 duelov a dal 427 gólov.
V reprezentácii odohral 97 stretnutí a pripísal si 41 zásahov. Predstavil sa na troch majstrovstvách sveta, nastúpil aj na olympiáde v Pekingu, kde získal zlato.
"Som veľmi šťastný zo všetkých úspechov, ktoré som dosiahol. Každý môže povedať, že sa dá vždy získať viac, no myslím si, že som dokázal zo seba dostať maximum," zhodnotil svoju kariéru Agüero podľa agentúry AP.